O Custóias Futebol Clube foi fundado em 1942 por um grupo de associados que entendeu, na altura, filiar a equipa na Associação de Futebol do Porto. Isto depois do Custóias passar por um largo período sem qualquer filiação.
Durante muito tempo o Custóias Futebol Clube sobreviveu com bastantes dificuldades. Esteve, por várias vezes, na iminência de desaparecer, não fora a boa vontade de alguns cidadãos.
Mas, com o decorrer dos anos, a situação do clube foi melhorando. Hoje tem no seu historial alguns títulos regionais de Futebol de onze que são o orgulho da vila e, mais particularmente, dos seus associados.
Actualmente tem cerca de 500 sócios e disputa o Campeonato Distrital da 1ª Divisão. Concorre todos os anos aos vários escalões do futebol juvenil no campeonato da Associação de Futebol do Porto. Nas suas fileiras tem mais uma modalidade: Voleibol masculino e feminino em seniores. Ao todo movimenta cerca de 150 atletas.